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微生物共现网络图怎么做
用origin做微生物网络互作图方法如下：第一步、打开软件，数据导入origin，longname：输入各微生物的名字；units：输入单位；comments：不用填。
在每个主要分支下，绘制几个子分支，以详细描述相关的结构、功能和作用。在每个子分支下，添加更多的支线，以进一步说明细节、引用特定的语句等。在整个思维导图上使用颜色、符号和图片等可视化元素来帮助记忆和理解。
步骤如下：择样本并进行微生物群落分析，得到微生物组成数据，根据微生物组成数据，构建微生物共现网络。对微生物共现网络进行模块化分析，将微生物共现关系密集的节点聚类为一个模块。
通过相互作用模式看。因为知***键词共现网络图指的就是一些微生物群落间的相互作用模式，所以通过这些微生物之间的相互作用模式就可以看懂网络图之间的关系。
如何建立微生物的进化树网络分析
1、特征序列有助于迅速确定某种微生物的分类归属，或建立新的分类单位。 系统发育树 通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系统树，其特点是用一种树状分枝的图型来概括各种（类）生物之间的亲缘关系。
2、Distance-based methods 距离法：（基于距离的方法：首先通过各个物种之间的比较，根据一定的***设（进化距离模型）推导得出分类群之间的进化距离，构建一个进化距离矩阵。进化树的构建则是基于这个矩阵中的进化距离关系。
3、进化树怎么分析 （1）水平方向：遗传变量的变化程度 水平方向上的分支代表进化谱系随着时间的变化，分支长度越长表示该分支对应物种的变化越大。
4、一般通过NJ构建进化树，并且进行Bootstrap分析所得到的结果已足够。如果序列近缘，可以再使用MP构建进化树，进行比较。如果序列较远源，则可以做ML树比较。
5、用Bootstrap构建进化树，MEGA的主要功能就是做Bootstrap验证的进化树分析，Bootstrap验证是对进化树进行统计验证的一种方法，可以作为进化树可靠性的一个度量。各种算法虽然不同，但是操作方法基本一致。
微生物共现网络图分三块原因
1、通过相互作用模式看。因为知***键词共现网络图指的就是一些微生物群落间的相互作用模式，所以通过这些微生物之间的相互作用模式就可以看懂网络图之间的关系。
2、因此，微生物共现性网络中的不同模块之间是存在互通性的。这种互通性对于深入理解微生物生态系统和微生物之间的相互作用具有重要意义。
3、社区结构分析：利用社区发现算法，将网络中相互联系紧密的节点聚类成社区。比较不同处理的社区结构，可以发现处理条件对微生物群落结构的影响。
4、将微生物共现关系密集的节点聚类为一个模块。对每个模块进行微生物分类，将属于细菌、真菌、古菌的微生物分别标记出来。分析不同微生物分类的模块特征和网络特征，比较其在微生物共现网络中的作用和关系。
5、微生物网络图需要两组数据。微生物网络图需要边文件数据和点文件数据，共两个数据，所以微生物网络图需要两组数据。
微生物网络分析怎么按细菌真菌古菌分析
1、节点度分析：计算每个节点在网络中的度数，即与其他节点相连接的数量。比较不同处理的节点度分布，可以了解各个处理条件下微生物的连接程度和复杂性。 节点中心性分析：节点中心性指标反映了网络中节点的重要性。
2、病毒没有细胞结构，大小上要比细菌真菌小很多，不能独立生存。可以根据各自的特点利用显微镜观察，或者利用他们的生物学特性，通过实验加以区分。
3、形态 单个古菌细胞直径在0.1到细菌的基本形态有三：球形、杆真核生物范围很广，有大有 15微米之间，有一些种类形成形和螺旋形。此外，有的细菌还小，形态各异。细胞团簇或者纤维，长度可达有荚膜，鞭毛以及芽孢。
4、真菌是真核生物，有成型的细胞核。真菌的大多数种类是单细胞个体细胞内不含叶绿素，不能进行光合作用制造，有机物只能进行腐生或寄生的生活，用孢子进行繁殖。
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