微生物宏基因组学,微生物宏基因组学研究

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大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于微生物基因组学的问题,于是小编就整理了4个相关介绍生物基因组学的解答,让我们一起看看吧。

  1. 宏基因检测样本是什么?
  2. dna条形码和宏基因组的区别?
  3. 宏基因组三代测序的优缺点?
  4. 怎么看宏基因组的大小?

宏基因检测样本是什么

是微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能

dna条形码和宏基因组的区别?

宏基因组 ( m etagenom e) , 也称环境微生物基因 组或元基因组, 是指环境中全部微小生物 ( 目前主 要包括细菌真菌 ) DNA 。DNA条形码已经成为生态学研究的重要工具,不仅用于物种鉴定,同时也帮助生物学家进一步了解生态系统内发生的相互作用。在发现一种未知物种或者物种的一部分时,研究人员便描绘其组织的DNA条形码。

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宏基因组三代测序的优缺点?

①.一代测序

优势:

1. 第一代测序技术的准确性远高于二、三代测序,因此被称为测序行业的“金标准”;

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2. 第一代测序每个反应可以得到700-1000bp的序列,序列长度高于二代测序;

3. 第一代测序价格低廉,设备运行时间短,适用于低通量的快速研究项目

劣势:

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1. 第一代测序技术一个反应只能得到一条序列,因此测序通量很低;

2. 第一代测序技术虽然单个反应价格低廉,但是获得大量序列的成本很高。

②.二代测序

优点:

怎么看宏基因组的大小?

基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量。在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小。通常使用单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value。通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量。不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述。不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力。

到此,以上就是小编对于微生物宏基因组学的问题就介绍到这了,希望介绍关于微生物宏基因组学的4点解答对大家有用。

标签: 基因组 测序 微生物