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大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于中国微生物资源数据库问题,于是小编就整理了3个相关介绍中国微生物***数据库的解答,让我们一起看看吧。

  1. 什么是人体微生物组计划(HMP)?
  2. 微生物数据库建立的意义?
  3. 微生物的分类鉴定技术主要有哪些?

什么人体微生物组***(HMP)?

作为与人类共生生命体,人体中的微生物都是以万亿数量级进行统计的。它们与生俱来,甚至我们出生时也携带着从母亲获得的菌群。它们与人类共进退,但我们却对如此忠诚的伙伴所知甚少。在2007年,美国国立卫生研究院一声令下,诞生了史上最大的人体微生物探索项目——人类微生物组***(HMP)。

在过去十几年中,科学界在人类微生物研究上投入了超过17亿美元的资金,大部分相关的课题研究都来自于美国、欧洲、中国等地区。如此庞大的资金和研究链无不体现了科学家对人体微生物的关注。此前微生物学界也获得了不少突破性的进展,例如新生儿会从母亲获得关键性的微生物群;乳汁中无法消化的糖类可以促进婴儿肠胃中微生物的生长,而微生物成长后,又可以反过来增强婴儿免疫系统功能。但遗憾地是,这些零散的研究很难理清微生物群体、人体以及疾病这三者的关系

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但这一尴尬的局面在21世纪初期出现了转折,2005年开始,DNA测序技术成本逐渐开始下降,美国国立卫生研究院(NIH)决定开展针对人体微生物群体的大型研究***。2007年,美国投入了2亿美元启动了庞大的人类微生物组***(Human Microbiome Project,HMP),旨在推进更先进的微生物领域的发展包括更新计算分析工具临床标准以及建立微生物参考数据库。

HMP***的第一阶段主要是指2007年启动至2016年,第一个十年的研究进展。在该阶段中,研究主要是分析身体五大部位的微生物群体,包括口腔皮肤、鼻腔、肠胃道和泌尿生殖道,为了探究固定部位的微生物社群是否与人体的特定疾病存在联系。在第一阶段中,HMP制定了五大部位的临床样本标准。除此之外,HMP 还建立了各类微生物的全基因组序列,目前这些序列在NCBI上都能直接获取。

微生物数据库建立的意义?

由于生物信息数据的高速增长,同时为了满足生物信息学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据,大量生物信息数据库应运而生。数据库及其相关的分析软件是生物信息学研究和应用的重要基础,也是生物信息学研究必备的工具。好的数据库就像一个宝藏在等待我们挖掘,更像一朵美丽的花,静静的散发芳香。

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微生物的分类鉴定技术主要有哪些?

微生物的种类繁多,要快速定性定量检测传统的方法确实是很有难度的,要精准快速地检测最好还是选质谱鉴定的方法。

质谱鉴定之所以精准的原因是因为质谱可以通过鉴定微生物代谢组来确定微生物的种类。

微生物种类繁多,许多亚型的基因,甚至蛋白组可能高度类似,而代谢组作为一个微生物最直接的功能表型,是区分微生物种类最直接的手段。

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而且质谱相比传统PCR鉴定也更高效,质谱的精准度很高,只需要微量样品,而且对于定性微生物鉴定也不需要知晓微生物的信息,直接通过代谢即可判定微生物是否为同一类。可谓是省时省力高效,只是价格稍微高一点。

现在质谱检测也都很普遍了,比起早些年价格已经很优惠了,国内一些质谱公司,例如百泰派克就做的很好的,价格也是同行里较为优惠,你可以咨询看看。

利用微生物对不同碳源代谢率的差异,针对每一类微生物筛选 95 中不同碳源,配合四唑类显色物质(如 TTC、TV) ,固定于 96 孔板上(A1孔为阴性对照) ,接种菌悬液后培养一定时间,通过检测微生物细胞利用不同碳源进行新陈代谢过程中产生氧化还原酶与显色物质发生反应而导致的颜色变化 (吸光度)以及由于微生物生长造成的浊度差异,与标准菌数据库进行比对,即可得出最终结果。

到此,以上就是小编对于中国微生物***数据库的问题就介绍到这了,希望介绍关于中国微生物***数据库的3点解答对大家有用。

标签: 微生物 质谱 数据库