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疑似背景微生物什么意思?
疑似背景微生物是指在实验或采样过程中所出现的微生物,可能并非实验或***样对象的微生物。
原因是环境中存在大量微生物群落,包括空气、试剂、器具等,这些微生物可能随着实验或***样进程进入到实验样本中,导致实验结果的误判。
因此,疑似背景微生物的存在影响实验的准确性,需要进行相应的处理,如空白对照实验、筛选感兴趣微生物的特征等。
什么叫做背景微生物?
一种病原检测背景微生物判断方法,其特征在于,包括以下步骤:确定核心背景微生物列表:取若干生物样本,测序,获得高频且稳定出现在样本中的微生物种类,并获得该微生物的特异性比对序列数,将相应样本的核酸提取浓度或文库浓度与该微生物的特异性比对序列数进行相关性检验,得到相关性呈负相关的微生物列表,去除此列表中既是背景又是病原的微生物以及常见微生态细菌,即得核心背景微生物列表。
ont技术?
随着科技的进步和革新,以检测单个DNA或RNA分子碱基的第三代测序(TGS)应运而生。其中,作为TGS平台翘楚的是Oxford Nanopore Technologies (ONT)。迄今为止,ONT技术已圆满完成了多项病原微生物检测和研究工作。研究表明,ONT技术在临床环境中检测病原微生物和耐药性基因相较二代NGS技术具有更高的准确性、更短的运行周期、更低成本、更低空间占用。最新VolTRAX实现了样本核酸自动化提取、上样测序、数据分析(病原、抗性基因鉴定分析)、治疗方案制定等一站式服务
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